Υποβόσκει η κρίση στους κόλπους της Ιεραρχίας και τη φορά αυτή εκδηλώθηκε με αφορμή το επίμαχο θέμα της καύσης των νεκρών. Η διαμάχη ξέσπασε ανάμεσα στον αρχιεπίσκοπο Χριστόδουλο και στον μητροπολίτη Ιωαννίνων Θεόκλητο, με αφορμή τη θέση που έχει εκφράσει ο δεύτερος, ο οποίος αναγνωρίζει στην πολιτεία το δικαίωμα να νομοθετεί, σε αντίθεση με τον αρχιεπίσκοπο, ο οποίος διεκδικεί για την Εκκλησία το αποκλειστικό δικαίωμα να καθορίζει τον τρόπο χειρισμού των νεκρών. Ο αρχιεπίσκοπος έστειλε επιστολή στον μητροπολίτη Ιωαννίνων, με την οποία τον επιπλήττει και του θυμίζει τις εγκυκλίους που έχει εκδώσει με βάση τις οποίες απαγορεύεται στους μητροπολίτες να μιλάνε στα μέσα ενημέρωσης χωρίς άνωθεν άδεια. Ο Θεόκλητος, ο οποίος στο μεταξύ παραιτήθηκε από διευθυντής της οικονομικής υπηρεσίας, έστειλε στον Χριστόδουλο απαντητική επιστολή, με την οποία του ζητάει να ανακαλέσει και μάλιστα αποκαλεί τον αρχιεπίσκοπο "συνεπίσκοπο", αρνούμενος έτσι να δεχτεί να τεθεί υπό τις διαταγές του Χριστόδουλου.