Συνεχίζονται τα προβλήματα και οι καταγγελίες σχετικά με τις εξετάσεις στο Διεπιστημονικό Κέντρο Αναγνώρισης Τίτλων Σπουδών Αλλοδαπής (ΔΙΚΑΤΣΑ) για τους απόφοιτους Ιατρικής και Οδοντιατρικής. Ετσι, μετά την αυθαίρετη άνοδο της βάσης στις εξετάσεις του Νοέμβρη του 2003, που είχε ως αποτέλεσμα εκατοντάδες προσφυγές στο Συμβούλιο της Επικρατείας (οι οποίες πρόκειται να εκδικαστούν τον Οκτώβρη και αναμένεται να δικαιωθούν), τώρα οι αντιδράσεις επικεντρώνονται στο σύστημα της αρνητικής βαθμολογίας, με το οποίο διενεργήθηκαν οι τελευταίες εξετάσεις. Σύμφωνα με αυτό οι εξεταζόμενοι συγκεντρώνουν από ένα βαθμό για κάθε σωστή απάντηση που δίνουν, ενώ από το σύνολο της βαθμολογίας που συγκεντρώνουν αφαιρείται 1/4 του βαθμού για κάθε λάθος απάντηση (ένας βαθμός για κάθε τέσσερις απαντήσεις). Η νομιμότητα του συστήματος αρνητικής βαθμολογίας, που έχει εφαρμοστεί παλαιότερα σε διαγωνισμούς του ΑΣΕΠ, αμφισβητείται έντονα και ήδη υπήρξαν προσφυγές στο ΣτΕ και σχετικά με τις τελευταίες εξετάσεις του ΔΙΚΑΤΣΑ.

Παράλληλα, μετά τις τελευταίες εξετάσεις προέκυψαν αντιδράσεις σχετικά με το βαθμό δυσκολίας των θεμάτων Παθολογίας και τη διάρκεια του χρόνου εξέτασης.