Ερωτήματα διατυπώνει η Ομοσπονδία Τελωνειακών Υπαλλήλων, σχετικά με την υπόθεσης παράνομης επιστροφής ΦΠΑ, που δημοσιοποιήθηκε πρόσφατα από το υπουργείο Οικονομίας. Σύμφωνα με τους ισχυρισμούς των τελωνειακών, οι ενδοκοινοτικές συναλλαγές αποτελούν τον κύριο όγκο της υπόθεσης αυτής και για τις οποίες η Τελωνειακή Υπηρεσία δεν έχει καμία συμμετοχή. Παράλληλα, σύμφωνα με τους τελωνειακούς, δεν αποδείχτηκε ότι έγιναν εικονικές εξαγωγές προς τη Βουλγαρία, καθώς δεν έχει καν ξεκινήσει η διασταύρωση στοιχείων με τα βουλγαρικά Τελωνεία στο πλαίσιο της «διοικητικής συνδρομής» ανάμεσα στις δυο χώρες.