Την ενοχή του ιερέα Αντώνη Παπανικολάου για συνολικά πέντε πράξεις που σχετίζονται με κακοποιήσεις ανηλίκων πρότεινε η εισαγγελέας του Τριμελούς Πλημμελειοδικείου στη δίκη για την «Κιβωτό του Κόσμου». Η εισαγγελέας ζήτησε, επίσης, την καταδίκη ακόμα πέντε κατηγορουμένων, όλοι τους στελέχη της προβεβλημένης ΜΚΟ σε διάφορες δομές της επικράτειας, που κατά περίσταση κατηγορούνται για σωματική βλάβη κατά αδύναμων ατόμων που δεν μπορούν να υπερασπιστούν τον εαυτό τους, απειλή, έκθεση και άλλα. Παράλληλα, πρότεινε την πλήρη απαλλαγή δύο κατηγορουμένων πρώην υπαλλήλων της οργάνωσης.

Να σημειωθεί ότι η δίκη αφορά μόνο σε πλημμελήματα. Την πεποίθηση πως ο ιερέας «είχε έναν κυρίαρχο και ενεργό ρόλο» και «η άποψή του ήταν καθοριστική για την πορεία της οργάνωσης» εξέφρασε νωρίτερα στην πρότασή της η εισαγγελέας.