Την παραίτησή του από τη θέση του γενικού γραμματέα Ανθρωπίνων Δικαιωμάτων από το υπουργείο Δικαιοσύνης, υπέβαλε ο Κ. Παπαϊωάννου. Με δήλωσή του, κάνει έναν απολογισμό των 20 μηνών που έμεινε στη θέση αυτή και μεταξύ άλλων σημειώνει ότι «στη σημερινή συγκυρία κάθε θεσμική υποχώρηση κοστίζει πολύ ακριβά, είτε αφορά στις σχέσεις κράτους και Εκκλησίας είτε στα θεμελιώδη δικαιώματα των προσφύγων».