Την παραίτησή του από τη θέση του προέδρου της Ελληνικής Ποδοσφαιρικής Ομοσπονδίας ανακοίνωσε ο Θοδωρής Ζαγοράκης μέσω δημόσιας επιστολής του, στην οποία αναφέρεται και στους λόγους που τον οδήγησαν στη συγκεκριμένη κίνηση. Ο πρώην διεθνής ποδοσφαιριστής και αρχηγός της Εθνικής ομάδας το 2004, στην κατάκτηση του Euro, παραιτήθηκε από πρόεδρος της ΕΠΟ μόλις 165 μέρες μετά την ανάληψη της θέσης αυτής στις εκλογές που πραγματοποιήθηκαν την περασμένη άνοιξη. Η υποψηφιότητά του, που ήταν η μοναδική στην εκλογική διαδικασία, αποτελούσε επιλογή της κυβέρνησης και είχε τη στήριξη των λεγόμενων ισχυρών του ελληνικού πρωταθλήματος.

Στην επιστολή του ο Θ. Ζαγαράκης αναφέρεται ανάμεσα σε άλλα στο οξυμένο κλίμα που επικρατεί στο ελληνικό ποδόσφαιρο και οδηγεί στην απαξίωσή του, ενώ αφήνει αιχμές για «διαφορετική φιλοσοφία» εντός των κύκλων της ΕΠΟ και για εμπόδια στο έργο που προσπάθησε να κάνει ως πρόεδρος. Ειδική αναφορά κάνει στην υιοθέτηση από πλευράς κυβέρνησης της ολιστικής μελέτης των FIFA - UEFA για το ελληνικό ποδόσφαιρο (ψηφίστηκε κατά πλειοψηφία στη Βουλή), για την οποία - όπως επισημαίνει - χρειάστηκαν σκληρές διαπραγματεύσεις με τους εκπροσώπους των δύο διεθνών ποδοσφαιρικών οργανισμών.